困惑：：感到疑难，不知所措。
疑惑：迷惑,不理解
据《现代汉语词典》（2005年第五版）解释：
困惑：
（1）形容词，感到疑难，不知道该怎么办：~不解|十分~。
（2）动词，使困惑：这个问题一直~着他们。
疑惑：
疑和惑的意思都是乱。新华出版社《现代汉语辞海》解释为：心里不明白，不相信。
同 都有不明白的意思
异 困惑不知道该怎么办
疑惑是不相信
仅供参考
两者意思较为接近，疑惑偏“未知、不能肯定”；困惑偏“矛盾，费解”
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