从你的描述看，第1.采购产品时供应商的品名叫A，销售和客户签合同时，用了A的别名，供应商财务开发票时拒绝给客户开品名A别名的发票，这是供应商自己的问题，如果不开与合同一样的名称，可以拒绝付款的。
第2.和供应商签订合同时，写的产品名称叫A的别名，你们验收入库时，库房的入库信息也是A的别名入库的，你们收到供应商的发票时，发现供应商按照A的学名开的发票，现在不管是不是一个东西，如果供应商真的因种种原因无法开具别名发票，你们双方协商下在发票备注处备注成A的别名就行了，应该很好处理的，也不违法不违规的，财务就会接收。
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